43岁做三代试管怀孕后小孩出现畸形的概率不会很高，因为三代试管PGD/PGS胚胎筛查技术可以筛选出染色体或基因有问题的胚胎，选择健康胚胎进行移植，从而大程度上减少胎儿发育畸形的概率，所以大家不要担心，试管期间积极配合医生治疗即可。
43岁试管婴儿畸形率受到很多因素的影响，比如遗传因素和环境因素引起，具体情况是因人而异的，需要结合不同情况进行不同分析，如果高龄孕妇在试管怀孕期间出现以下情况，那么小孩出现畸形的可能性就会很高：
1、有毒气体：胎儿在发育过程中如果受到一些有毒污染物质的影响，可能会是染色体发生突变，这些有毒气体进入到胎儿体内，严重干扰胎儿发育，从而引起畸形或是自然流产;
2、羊水过少：43岁女性做三代试管婴儿怀孕后，如果羊水过少，胎膜可与胎体粘连，从而引发胎儿畸形，比如胎儿肌肉骨骼畸形，例如斜颈、手足畸形等等;
3、病毒感染：孕期母亲感染某些微生物可导致胎儿畸形，如风疹、巨细胞、单纯疱疹、弓形虫、梅毒等
