优点：优生优育，能排除基因缺陷和遗传病、可以选择性别；
缺点：对胚胎质量等级要求较高，需要在胚胎发育到第5天囊胚中进行，且无法一次完成疗程，因此有可能出现无健康胚胎移植、费用较贵、国内还不是很普遍，但在泰国、美国、俄罗斯等国家已经很普及了；
、只要能获得男性的一个健康精子，就有可能让女性成功怀孕。这是辅助生殖助孕领域里程碑式的突破，为广大男性因素不育患者带来希望。
第二代试管婴儿的这一缺点还未得到解决，但是宝妹觉得我们应该庆幸还有缺点在。可以这么说吧，正是因为有缺点的存在，才能促使它更加有动力向前进，力争将这项技术做到尽善尽美!如果第二代试管婴儿技术从研发之初就没有瑕疵、毛病的存在，那它也就失去了继续提升自我的兴致了!
一个完整的试管周期，包括了身体检查，促排卵，取卵取精，体外受精并培养，胚胎移植，验孕这几个步骤。而第三代试管婴儿技术可以理解为额外增加了一个步骤，即在胚胎移植前，对培养好的胚胎，进行胚胎植入前遗传学诊断(PGD)或筛查(PGS)。其医学价值在于能避免出现胎儿缺陷，达到优生优育的目的。
相比起第第二代试管婴儿，第三代试管婴儿的优点也正在这里。第第二代试管婴儿技术确实能让一些不孕不育夫妻成功怀孕，并顺利生下孩子。但是从技术上来说，是不能百分百保证所移植入母体子宫的胚胎是健康的，一旦选择了一个染色体异常或有遗传病基因的胚胎进行移植，很可能造成胚胎着床失败，生化妊娠或者生出畸形儿。
特别是一些高龄女性，由于卵子质量较低，胚胎很容易染色体异常，后果通常就是胎停流产。还有一些人群，家族上有单基因遗传病，如地中海贫血，血友病等。他们在生育时，也有几率将带病基因遗传给孩子。如若不巧夫妻二人同时携带致病基因，那生出来的孩子可能就会表现出重症病状。这些问题，是第第二代试管无法解决的。
而第三代试管婴儿技术正好可以弥补第二代试管婴儿技术的不足，重点就在于PGD和PGS技术。PGD指的是胚胎移植前遗传学诊断，也就是用于检查胚胎是否携带有遗传缺陷的基因。此项技术能够检查出一百多种疾病，如血友病、杜氏肌营养不良症、地中海贫血、马凡综合征等。PGS指的是胚胎植入前遗传学筛查，也就是对早期胚胎进行染色体数目和结构异常的检测。此项技术可以通过一次性检测胚胎23对染色体的结构和数目，分析胚胎染色体是否异常。这样不仅能保证筛选到健康的胚胎进行移植，提高试管婴儿成功率，还能避免因胚胎有问题而导致胎儿出现异常或缺陷儿的出生。
如果要说第三代试管婴儿的缺点，可能就是费用会稍贵一些。因为增加了胚胎移植前遗传学诊断/筛查的步骤，也消耗更多的的人力和物力(必须要非常有经验的医生和胚胎师来进行操作，所用的仪器也是非常精密且昂贵的)。所以第三代试管婴儿的价格会相对较贵。当然，相比起多出的这些价格，显然是高成功率和宝宝健康更为重要。
